L'ILAP repose sur un échantillon de 3216 ménages répartis entre le secteur autonome de Bissau (672 ménages) et les autres régions du pays (2544 ménages). La base de sondage ayant servi à la sélection de cet échantillon est constituée des districts de recensements (DR) définis lors du Recensement Général de la Population de 1991. Le travail de mise à jour des listes des ménages des DR de Bissau a été fait au mois de décembre 2001 dans le cadre du projet de création d'un Indice Harmonisé des Prix à la Consommation calculé dans les capitales des pays de l'UEMOA (Union Économique et Monétaire Ouest Africaine), tandis que celles des DR du reste du pays ont été dressées par les équipes d'enquêteurs.
La base a ensuite été repartie en huit (7) strates sur lesquelles ont été menées des études approfondies. Ces strates étaient Bafatá, Gabú, Cacheu Oio Biomba/Bolama, Quínara/Tombali et le secteur autonome de Bissau.

Le sondage a donc été stratifié et à deux degrés. Au premier degré, on a tiré des DR de façon systématique et proportionnellement à la taille exprimée en nombre de ménages. A l'intérieur de chaque DR, un nombre constant de 12 ménages a été choisi au deuxième degré.